Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSH2P0DML3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms