Protein–RNA interactions for Protein: P0C870

JMJD7, JmjC domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD7P0C870 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
JMJD7P0C870 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JMJD7P0C870 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms