Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPN1P04843 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPN1P04843 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN1P04843 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPN1P04843 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPN1P04843 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPN1P04843 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPN1P04843 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPN1P04843 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPN1P04843 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPN1P04843 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPN1P04843 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPN1P04843 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPN1P04843 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN1P04843 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN1P04843 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN1P04843 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN1P04843 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN1P04843 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN1P04843 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN1P04843 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN1P04843 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN1P04843 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN1P04843 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN1P04843 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN1P04843 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN1P04843 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN1P04843 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPN1P04843 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPN1P04843 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms