Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A1P02730 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A1P02730 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms