Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASS1P00966 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ASS1P00966 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ASS1P00966 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASS1P00966 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASS1P00966 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASS1P00966 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASS1P00966 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASS1P00966 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASS1P00966 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASS1P00966 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASS1P00966 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASS1P00966 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASS1P00966 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASS1P00966 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASS1P00966 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASS1P00966 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASS1P00966 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASS1P00966 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASS1P00966 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASS1P00966 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASS1P00966 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASS1P00966 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ASS1P00966 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASS1P00966 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASS1P00966 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASS1P00966 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASS1P00966 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASS1P00966 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASS1P00966 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASS1P00966 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASS1P00966 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASS1P00966 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASS1P00966 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASS1P00966 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASS1P00966 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASS1P00966 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASS1P00966 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms