Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC24AO95486 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms