Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SKAP2O75563 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms