Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIA3O75145 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms