Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR5O60602 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR5O60602 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLR5O60602 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR5O60602 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR5O60602 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR5O60602 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR5O60602 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR5O60602 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR5O60602 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR5O60602 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR5O60602 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR5O60602 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR5O60602 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR5O60602 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR5O60602 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR5O60602 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR5O60602 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR5O60602 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR5O60602 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR5O60602 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR5O60602 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR5O60602 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR5O60602 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR5O60602 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR5O60602 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR5O60602 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR5O60602 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR5O60602 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR5O60602 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR5O60602 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR5O60602 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR5O60602 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR5O60602 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR5O60602 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR5O60602 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR5O60602 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms