Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNQ3O43525 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms