Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNAB3O43448 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 437.7 ms