Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCF2LO15068 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms