Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOCS3O14543 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SOCS3O14543 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms