Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
O00370 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
O00370 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
O00370 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
O00370 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
O00370 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
O00370 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
O00370 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
O00370 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
O00370 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
O00370 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
O00370 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
O00370 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
O00370 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
O00370 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
O00370 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
O00370 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
O00370 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
O00370 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
O00370 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
O00370 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
O00370 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
O00370 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
O00370 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
O00370 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
O00370 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
O00370 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
O00370 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
O00370 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
O00370 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
O00370 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
O00370 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
O00370 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
O00370 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
O00370 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms