Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIEO00221 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NFKBIEO00221 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKBIEO00221 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms