Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP23O00161 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNAP23O00161 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms