Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms