Protein–RNA interactions for Protein: H0YCG3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H0YCG3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H0YCG3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H0YCG3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H0YCG3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H0YCG3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H0YCG3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H0YCG3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H0YCG3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H0YCG3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H0YCG3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H0YCG3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H0YCG3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H0YCG3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H0YCG3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H0YCG3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H0YCG3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H0YCG3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H0YCG3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H0YCG3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H0YCG3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
H0YCG3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H0YCG3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H0YCG3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H0YCG3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H0YCG3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H0YCG3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H0YCG3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H0YCG3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H0YCG3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H0YCG3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H0YCG3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H0YCG3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H0YCG3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H0YCG3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H0YCG3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H0YCG3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H0YCG3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H0YCG3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H0YCG3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H0YCG3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H0YCG3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H0YCG3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H0YCG3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H0YCG3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H0YCG3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H0YCG3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H0YCG3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H0YCG3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H0YCG3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H0YCG3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H0YCG3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H0YCG3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H0YCG3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H0YCG3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H0YCG3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H0YCG3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H0YCG3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H0YCG3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H0YCG3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H0YCG3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H0YCG3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H0YCG3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H0YCG3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H0YCG3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms