Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
E9PCH4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
E9PCH4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
E9PCH4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
E9PCH4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
E9PCH4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
E9PCH4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
E9PCH4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
E9PCH4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
E9PCH4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
E9PCH4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
E9PCH4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
E9PCH4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
E9PCH4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
E9PCH4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
E9PCH4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
E9PCH4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
E9PCH4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
E9PCH4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
E9PCH4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
E9PCH4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
E9PCH4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
E9PCH4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
E9PCH4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
E9PCH4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
E9PCH4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
E9PCH4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
E9PCH4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
E9PCH4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
E9PCH4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
E9PCH4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
E9PCH4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
E9PCH4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
E9PCH4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
E9PCH4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
E9PCH4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
E9PCH4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
E9PCH4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
E9PCH4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
E9PCH4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
E9PCH4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
E9PCH4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
E9PCH4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
E9PCH4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
E9PCH4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
E9PCH4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
E9PCH4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
E9PCH4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
E9PCH4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
E9PCH4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
E9PCH4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
E9PCH4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
E9PCH4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
E9PCH4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
E9PCH4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
E9PCH4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
E9PCH4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
E9PCH4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
E9PCH4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
E9PCH4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
E9PCH4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
E9PCH4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
E9PCH4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
E9PCH4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
E9PCH4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
E9PCH4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
E9PCH4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
E9PCH4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
E9PCH4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
E9PCH4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
E9PCH4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
E9PCH4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
E9PCH4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
E9PCH4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
E9PCH4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
E9PCH4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
E9PCH4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
E9PCH4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
E9PCH4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
E9PCH4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
E9PCH4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
E9PCH4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
E9PCH4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms