Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UPK3BL2E5RIL1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPK3BL2E5RIL1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms