Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATL2C9JE40 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms