Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf172C9J069 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf172C9J069 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf172C9J069 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf172C9J069 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf172C9J069 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms