Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD3A6NKT7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD3A6NKT7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms