Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms