Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POTEFA5A3E0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEFA5A3E0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms