Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRD1A4D1F6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRD1A4D1F6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms