Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPDC1A2A3K4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms