Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQE9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQE9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQE9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
U3KQE9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
U3KQE9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
U3KQE9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
U3KQE9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
U3KQE9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
U3KQE9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U3KQE9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms