Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms