Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F0

PCDHB13, Protocadherin beta-13, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB13Q9Y5F0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHB13Q9Y5F0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB13Q9Y5F0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms