Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4BQ9Y4P1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms