Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRELID3BQ9Y3B1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRELID3BQ9Y3B1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms