Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.95■■■■■ 5.59
NISCHQ9Y2I1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC49.95■■■■■ 5.59
NISCHQ9Y2I1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
NISCHQ9Y2I1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.94■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC49.94■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC49.93■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.93■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC49.93■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC49.93■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC49.92■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC49.92■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC49.92■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.91■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.91■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.91■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC49.91■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC49.91■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.91■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC49.91■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC49.9■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC49.9■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC49.9■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC49.9■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC49.9■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC49.9■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC49.89■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC49.89■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC49.89■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC49.89■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC49.88■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC49.88■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC49.88■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC49.88■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
NISCHQ9Y2I1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC49.87■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC49.87■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC49.86■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC49.86■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC49.86■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC49.85■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC49.85■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC49.85■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC49.85■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC49.84■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC49.84■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC49.84■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC49.83■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC49.83■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC49.83■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC49.83■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.83■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC49.82■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC49.82■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC49.82■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC49.82■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC49.82■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC49.82■■■■■ 5.57
NISCHQ9Y2I1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC49.81■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC49.81■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC49.81■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.8■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC49.8■■■■■ 5.56
NISCHQ9Y2I1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC49.8■■■■■ 5.56
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