Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNH4Q9UQ05 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNH4Q9UQ05 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms