Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG5Q9UPR3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG5Q9UPR3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms