Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
L1RE1Q9UN81 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms