Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDHA12Q9UN75 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHA12Q9UN75 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms