Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU6

TRHDE, Thyrotropin-releasing hormone-degrading ectoenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHDEQ9UKU6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRHDEQ9UKU6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRHDEQ9UKU6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms