Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

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Length 801 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRDM4Q9UKN5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM4Q9UKN5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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