Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms