Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms