Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CFDP1Q9UEE9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CFDP1Q9UEE9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms