Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4Q9UBX2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4Q9UBX2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms