Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGSF9Q9P2J2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IGSF9Q9P2J2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9Q9P2J2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms