Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT4Q9P109 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT4Q9P109 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT4Q9P109 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT4Q9P109 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCNT4Q9P109 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCNT4Q9P109 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCNT4Q9P109 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCNT4Q9P109 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCNT4Q9P109 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT4Q9P109 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCNT4Q9P109 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCNT4Q9P109 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT4Q9P109 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms