Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCHIP1Q9P0W5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms