Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNKQ9P0W0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms