Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP1Q9NZI2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP1Q9NZI2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP1Q9NZI2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP1Q9NZI2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP1Q9NZI2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP1Q9NZI2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP1Q9NZI2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP1Q9NZI2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms