Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA3Q9NZ52 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms