Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZDHHC3Q9NYG2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZDHHC3Q9NYG2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms